A Comissão do Santuário estabeleceu um conjunto de regras ou regulamentos destinados a proteger esta espécie ameaçada e garantir a segurança das pessoas interessadas em observá-la.

A temporada de baleias jubarte se estende a cada inverno, de dezembro a abril.

Os capitães e tripulantes dos barcos continuarão a ser treinados. Também serão desenvolvidos programas de educação ambiental direcionados aos turistas de observação de baleias.

Regulamento de Observação de Baleias

-As embarcações que visitam o Santuário devem obedecer ao seguinte regulamento:
-A embarcação e/ou seus ocupantes não devem se aproximar a menos de 50m do local onde as baleias se encontram, e a menos de 80m quando na presença de mães com seus filhotes.
-Na área de observação de baleias, apenas uma embarcação poderá observar as baleias.
-A presença de várias embarcações juntas, sejam elas pequenas ou grandes, confundem as baleias.
-Cada embarcação não deve permanecer mais de trinta minutos com um determinado grupo de baleias.
-Cada embarcação não deve fazer nenhuma mudança brusca de direção e/ou velocidade quando estiver perto das baleias.
-Nenhum objeto pode ser jogado na água, e nenhum barulho desnecessário pode ser feito quando estiver perto das baleias.
-Se as baleias se aproximarem a menos de 100m da embarcação, o motor deve ser colocado em ponto morto até que as baleias sejam vistas se afastando da embarcação.
-A embarcação não pode interferir na direção do nado ou no comportamento natural das baleias. (As baleias podem deixar seu habitat natural se forem assediadas).

Medidas de Observação de Baleias

-Apenas 3 barcos são permitidos para observação de baleias ao mesmo tempo, o mesmo grupo de baleias. As demais embarcações devem ficar a 250 metros de distância aguardando sua vez para observação de baleias formando grupos de 3.
-As distâncias entre barcos e baleias são: para mãe e filhote, 80 metros, para grupos de baleias adultas 50 metros.
-Ao aproximar-se da zona de observação de baleias, a uma distância de 250 metros, todos os motores devem estar em ponto morto até à sua vez de observação de baleias.
-Os barcos estão autorizados a observar um grupo de baleias durante 30 minutos, se quiserem continuar a observação de baleias têm de encontrar outro grupo. No final de
temporada o tempo de observação das baleias pode ser pela metade dependendo da quantidade de baleias e visitantes.
-Nenhum barco pode deixar seus passageiros nadar ou mergulhar com as baleias na Baía de Samaná.
-Todos os passageiros em um barco com menos de 30 pés devem usar um colete salva-vidas o tempo todo.
-É proibido sobrevoar os animais a menos de 1000 metros de altitude.